El primer <<Programa de Coinversión Social>> se efectuó en la Ciudad de México, en 1997, entre el gobierno y NOVIB (actualmente OXFAM); y tuvo como resultado un Acuerdo de Inversión Paritaria en proyectos de desarrollo social, impulsados por organizaciones de la sociedad civil.

I. Etapa Fundacional en Chiapas, 2000-2001.
Al surgir la Iniciativa, se realiza una consulta amplia y se logra la firma de una Carta de Intención entre el Gobierno y la Cooperación Internacional; con compromisos de invertir paritariamente para el financiamiento de proyectos de desarrollo social.
Participan cuatro organizaciones en esta etapa.

II. Reflexión Estratégica, Crecimiento y Normatividad, 2001-2002.
Se Firma el Convenio Tripartita que da sustento jurídico al Programa.
Se amplia el número de organizaciones participantes de cuatro, a nueve.

III. Desarrollo y Consolidación, 2002- 2004.
Apertura de nuevos espacios bilaterales. Evaluación externa, se traza una ruta de institucionalización, formación de la Comisión Tripartita, y el seguimiento de Acuerdos.

IV. Institucionalización del Programa, 2004- 2006.
Foros de participación Social.
Se modifica el nombre del Programa.
Se abre públicamente el Programa a nuevos actores y se involucran nuevas OSC; de nueve pasa a quince, y para 2007, se unen quince más.
Se define su estructura organizativa: Tres espacios diferenciados y constituidos de participación.